לגונה היא מקווה מים רדוד ומלוח, אשר מופרד מן הים ע"י שונית או רצועת חול נמוכה אשר לעתים אינה עולה על פני המים.
לגונות החופים, מצויות במקומות שבהם הפרשי המפלס של הגיאות והשפל קטנים, והן נפוצות בשיעור של כשמינית ! מאורך החופים.
המים בלגונה נמצאים בעירבוב מועט עם פני הים ועל כן, נוצרים בלגונה תנאי סביבה מקומיים השונים מאוד מאלה אשר בים הפתוח. (כמו מליחות המים הנובעת מאידוי יתר בלגונה, טמפרטורת המים וכד'), מכאן -נוצרים בתי גידול שונים ומיוחדים ללגונה ומגוון בעלי החיים בה שונה.