חדר נקי - חדר או אולם אשר נשמרת בו רמת נקיון וסטריליזציה גבוהות אף מאלה הנשמרות בחדרי ניתוח, על פי תקנים שונים לחדרים נקיים - מותרת כמות מוגדרת של החלקיקים בכל מטר מעוקב מנפח החדר.
רמת נקיון כזו, נדרשת בתהליכי ייצור מסויימים למשל, בתעשיית התרופות, בתעשיית השבבים, בתהליכי גידול גבישים - לעתים גרגיר אבק בודד יכול לחבל בתהליך. האויר בחדר נקי מבוקר ע"י מערכות אוטומטיות של בקרת אקלים ומסנני אויר השומרים על טמפרטורה, לחות ורמת נקיון האויר.
בגדי העובדים בחדר הנקי, אף הם עשויים מחומרים מיוחדים אשר לא פולטים חלקיקים והם מצוידים במערכת נשימה מיוחדות, המונעות את זיהום החדר.
בתעשיות שונות קיימות דרישות נקיון שונות, בתעשיית המיקרו-אלקטרוניקה ישנה הקפדה גבוהה על מספר החלקיקים ועל רמת לחות שתהיה מדויקת כ-45% וטמפ' קבועה של 20 מע' צלזיוס במטרה למנוע היווצרות חשמל סטטי העלול להפריע בתהליכי הייצור. גם בתעשיית התרופות נדרשים חדרים נקיים במיוחד וכן בתעשיות הזכוכית וכד'.
קיים תקן בינלאומי המגדיר את כמות וגודל החלקיקים המותרים ב"חדר נקי" התקן הוא ISO 14644-1.